Всем привет!
Спасибо вам за советы и предложения, проблему решил!
Дело было, как я и опасался, в перекошенной крышки багажника. Ни перестановка петли, ни игра резинками, ни регулировка замка не помогли именно по этому.
Так что я поехал к кузовщикам и они всё наладили, пришлось разобрать весь багажник и собрать заново. Всё стало идеально, теперь всё открывается/закрывается как на иномарках, буквально одним пальцем!

Также была решена проблема с "выстреливанием" крышки багажника при открытии. Оказалось торсионы стояли настроенными на максимальное усилие, при открытии. Мне их переставили на середину, и всё стало отлично. Теперь при открытии, крышка багажника приподнимается только на половину, как я и хотел.
Вскоре поеду к ним же, но уже по другой распространённой проблеме – задние двери...