Если стоят заводские локеры и появляется вода в багажнике -
90 % течет из уплотнителя заливной горловины.
Если там где стрелки у вас вода и грязь, точно резинка горловины. Там можно увидеть трубу, уходящую вниз. Вот в нижней и дырка
фото

Такая же резинка есть со стороны арки, снизу

[свернуть]
Вот через нижнюю и течет.
Проверить, что это она просто. Сушите багажник, вынимаете ковер, катаетесь по лужам. В том месте сразу будет вода и грязь...
Там нужно замазывать резино-бутумной мастикой.Или можно поставить подкрылки, зарывающие заливную трубу, вот такие
фото

[свернуть]