[Watson]

У вас машины были до этого автовазовские, скажем самара или жигули, даже по сравнению с ними коробка шумная? Автовазовская коробка никогда абсолютной тишиной не отличалась, шумка там тоже на троечку, поэтому это может быть нормой. Сцепление попробуйте выжимать в пол, может недоключения передачи пропадут, а вот чуть большее усилие при включении вниз - нет, так и будет, это норма. Да, вы купили самую дешевую машину из продаваемых на рынке россии новых, держите это тоже в уме когда захотите абсолютной тишины иномарки классом выше. Комфорт стоит 685500 на сайте официалов за 90-сильную версию седана, 711500 за 16v, вы просто переплатили тыс. 40-80(в зависимости от версии движка и платного/бесплатного цвета) т.к. брали на ажиотаже.
Насчет вибрации - я замечал только шум иногда на прогреве, когда коробка полностью еще не прогрелась, у меня и на предыдущей калине это было причем значительно шумнее, коробка проходила больше 200 тыс. вообще без замечаний и проблем, и скорее всего у нового хозяина до сих пор ходит. Народ меняет подшипники и шестерни на импортные (во всяком случае на старые коробки без тросиков этот вариант работал), тогда шум уходит, если прямо так мешает что аж жить невозможно - можете сделать, но это уже за свой счет конечно. Вибрация - возможно от нового 90-сильного движка еще имеет место быть