Я не думаю, что что-то критичное может случится. У меня был старый регистратор с убитым контроллером заряда, т.е. батарейку он не заряжал, даже стороннюю, которую от Нокии впаял, и все равно работало все как часики. Полгода ездил постоянно в режиме вкл/выкл.
Каждая модель по разному относится к таким перепадам.
При не живом аккуме, при выдергивании прикуривателя, будет не завершенный и не стираемый регистратором файл, со временем забьет флешку. Если просто вкл\выкл кнопкой, то можно жить ... скорее всего у него он всегда воткнут, а перетыкать лениво.
Древовидный вид